Yayasan merupakan badan penyelenggara Universitas Nuku yang berkomitmen dalam pengembangan pendidikan tinggi yang berkualitas, profesional, dan berdaya saing. Melalui tata kelola yang baik, yayasan mendukung penyelenggaraan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat dengan menyediakan sumber daya, sarana prasarana, serta kebijakan strategis untuk meningkatkan mutu perguruan tinggi.
Sebagai penyelenggara Universitas Nuku, yayasan senantiasa berupaya menciptakan lingkungan akademik yang kondusif, meningkatkan kualitas sumber daya manusia, memperkuat kerja sama dengan berbagai pihak, serta mendukung pengembangan setiap program studi sesuai Standar Nasional Pendidikan Tinggi.